正享受短暂假期的公安九课少校草薙素子（坂本真绫 配音）突然接到巴特（松田健一郎 配音）的报告，西之内某处大厦遭受恐怖分子袭击，政府高官和商业巨擎被人杀害。在草薙的指挥下，九课的石川、波玛、帕兹、巴特等人通力合作，将恐怖分子彻底制服，但草薙在行动中意外受到神秘病毒感染。在西之内恐怖袭击的同时，远郊的水坝发生爆炸案。新滨县刑警陀古萨（新垣樽助 配音）传唤水坝管理企业负责人沙特博士，对方是来自饱经战火的卡森共和国的卡尔迪斯人。受警方高层施压，陀古萨没有得到任何有用信息。另一方面，草薙一方得知恐怖分子的真实身份，正是卡尔迪斯的游击队组织。两起案件意外联系在一起，其背后隐藏怎样的真相？
本片根据士郎正宗的原作改编，为攻壳机动队前传“ARISE”的第三部。
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兴津和幸 坂本真绫 山寺宏一 神木隆之介 三石琴乃 大原沙耶香 林原惠美 绪方惠美 宫村优子 石田彰 山口由里子 立木文彦 清川元梦 子安武人 优希比吕 长泽美树 中务贵幸 中村源太 大塚明夫 关智一 泽城美雪 伊濑茉莉也 川田绅司 下山吉光 斋藤千和 内山昂辉 手冢弘道 岩男润子 小野冢贵志 胜杏里 仪武祐子 武藏真之介 新祐树 前田玲奈 岩永哲哉 星野充昭 佐藤蓝 塙爱美 村田知沙 堀越真己 泷泽罗子 八百屋杏 虎岛贵明
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